Genel amaçlar açısından çok fark yoktur. Söz konusu terimler bu sitede, pek çok biyologun da yaptığı gibi, birbirinin yerine kullanılmaktadır. Özünde, her biri organizma grupları arasındaki evrimsel ilişkileri ifade eden bir ağaç yapısını betimler. Ağaçla ilgili asıl bilgiyi bu terimler değil, ağacın hazırlanış amacı verir. Örneğin, amaca göre ağaç dallarının uzunluğu hiçbir şey ifade etmeyebileceği gibi, genetik farklılığı ya da zamanı ifade ediyor olabilir. Veya çizilen soyoluş, organizmanın tarihi ile ilgili bir hipotez olabileceği gibi, organizmanın tarihinin bire bir bulgulu kaydı da olabilir. Ne var ki bazı biyologlar bu kelimeleri çok daha özgül anlamlarda kullanır. Bazılarına göre “dallanma grafiği” terimi, organizma grupları arasındaki mevcut evrimsel tarihe dair bir hipotezi vurgularken, “soyoluş” terimi ise bu ağaçların gerçek evrimsel tarihi betimlediğini gösterir. Başka bazı biyologlara göreyse dalların uzunluğu “dallanma grafiği”nde keyfi olarak belirlenirken, “soyoluş”larda dal uzunluğu karakter değişiminin miktarını gösterir. “Filogram” ve “dendogram” kelimeleri de zaman zaman birbirinden hafifçe farklı olan aynı türden şeyleri ifade etmek için kullanılır. Bu kelime farklılıklarının anlaşılması güçtür ve bu kelimeler biyoloji camiasında tutarlı bir biçimde kullanılmamaktadır. Bizim amaçlarımız açısından burada önemle hatırlanması gereken şey organizmaların akraba olduklarıdır. Organizmalar arasındaki akrabalık ilişkilerini ve onlar hakkındaki hipotezlerimizi bu ağaç yapılarıyla gösterebiliyoruz.